經(jīng)濟(jì)快捷的SNP位點(diǎn)研究方法-SNP基因分型

SNP，全稱(chēng) Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異。目前很多人仍然使用測(cè)序法來(lái)進(jìn)行研究，具有準(zhǔn)確、直觀的優(yōu)點(diǎn)。但有一種方法，能間接的研究SNP，且經(jīng)濟(jì)快捷，那就是——SNP基因分型。

其實(shí)現(xiàn)原理：熔解溫度（melting temperature,Tm）是指吸光值增加到最大值的一半時(shí)的溫度稱(chēng)為DNA的解鏈溫度或熔點(diǎn)。當(dāng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR中的熒光探針與靶基因錯(cuò)配，即靶基因序列上產(chǎn)生了核苷酸變異，他們的熔解溫度比較低。相對(duì)而言，沒(méi)有突變的靶基因與探針雜交的熔解溫度較高。通過(guò)區(qū)分熔解溫度的差異，來(lái)區(qū)分突變型和未突變型（野生型）。

進(jìn)行SNP基因分型需要注意：

1、將突變的位點(diǎn)放在探針中間。

2、保證兩條探針的熔解溫度相同。

熒光探針中，Taqman探針可進(jìn)行SNP基因分型。推薦Applied Biosystems公司的Taqman MGB探針，相對(duì)普通Taqman探針，與錯(cuò)配序列的熔解溫度相差更大。

分子信標(biāo)也可用于SNP基因分型。他的莖環(huán)結(jié)構(gòu)比一般線性的分子探針更適合SNP分型，莖環(huán)結(jié)構(gòu)與錯(cuò)配序列雜交的熱穩(wěn)定性更低，熔解溫度相差也更大。

讀者們可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求，選擇合適的方法進(jìn)行分析。